FABIA III phase 2 du 09/2018 au 05/2021

La gamme de moteurs comprend deux moteurs essence : un trois cylindres de 1,0 litre développant 60 et 75 ch, un TSI de 1,2 litre de 90 ch et un diesel TDI de 1,4 litre de 75 et 90 ch.

Peu avant le restylage, le 1,2 litre a été remplacé par une nouvelle version trois cylindres qui, grâce à l'ajout d'un turbocompresseur, atteignait 95 ch. Avec la mise à jour de 2018, la Fabia a abandonné ses moteurs diesel au profit de la version Monte Carlo de 110 ch. Pendant une courte période, la Škoda Fabia R5 a également été commercialisée. Il s'agissait d'une voiture de rallye équipée d'un moteur quatre cylindres turbocompressé de 1 620 cm³ développant 279 ch. Cependant, en raison des faibles ventes des modèles RS de la génération précédente, cette version n'est plus disponible.

Un modèle break est également produit. Il présente des caractéristiques techniques très similaires à celles de la berline, mais il est plus long et dispose d'un coffre plus spacieux.