TWINGO I phase 2 du 09/1998 au 06/2007

En 1999, la version haut de gamme, baptisée Initiale, fut lancée. Cette variante était dotée de sièges, de panneaux de porte et d'un soufflet de levier de vitesses en cuir, ainsi que de jantes en alliage. Ces dernières furent modernisées en 2000 avec un design à huit branches de 14 pouces, arborant le logo « Initiale Paris » au-dessus des clignotants latéraux. Un toit ouvrant en verre était également disponible. La même année, le prototype de la version sportive, la Twingo RS, fut présenté. Équipée d'un moteur 16 soupapes de 1,6 litre développant 110 ch, elle ne fut cependant jamais commercialisée.

Une nouvelle mise à jour, principalement mécanique, fut introduite en 2000, tandis qu'en 2001, un nouveau moteur, le D4F, fit son apparition. Conservant sa cylindrée de 1 149 cm³, il était désormais équipé d'un double arbre à cames en tête et d'une culasse à quatre soupapes, pour une puissance maximale de 75 ch. Aucune autre mise à jour n'a été apportée jusqu'en 2004, date à laquelle la voiture a bénéficié d'un léger lifting, intégrant le logo Renault à l'intérieur du bouton d'ouverture du hayon.